非侵入性樣品CNV評估試劑盒Embgenix? ESM Screen Kit
2024-03-04文章來(lái)源:takarabio
Embgenix? ESM Screen Kit
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· 可以提供對體外受精(IVF)實(shí)驗室收集的非侵入性樣品,比如胚胎培養液 (embryo spent media,ESM)以及囊胚腔液(blastocoel fluid),進(jìn)行拷貝數變異(CNV)評估的完整流程
· 使用PicoPLEX WGA技術(shù)可以對低起始量和片段化DNA進(jìn)行成功擴增
· 操作更加簡(jiǎn)便:一步法的WGA方法可以減少手動(dòng)操作時(shí)間,并且文庫構建包含片段化步驟
· 兼容更大的起始量(30 μl的培養基樣本)
· 靈活的工作流程,可兼容多種樣本起始數量 (24到96個(gè)樣本)
· 兼容Illumina的多款測序平臺,比如Miseq®、 NextSeq® 500/550
· 整合UDI建庫,在高通量型Illumina測序儀上有更好的樣本拆析與測序可靠性
· 可以使用Embgenix Analysis Software (RUO)對非侵入性樣品進(jìn)行數據分析
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■ 產(chǎn)品說(shuō)明:
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Embgenix ESM Screen Kit是一款僅供研究用途(RUO)的試劑盒。旨在對體外受精(IVF)周期內收集的非侵入性樣品,比如胚胎培養液以及囊胚腔液,進(jìn)行CNV評估??梢哉_識別24條染色體上的染色體非整倍體、節段性非整倍體(segmental aneuploidy )和嵌合體。
該試劑盒優(yōu)化用于較高體積的起始量樣本,包含的用于定量的模塊可準確定量非侵入性樣品中的cfDNA,并可兼容Illumina的多款測序平臺。
該試劑盒在包含核心的PicoPLEX專(zhuān)利技術(shù)(U.S. Patents 8,206,913)基礎上,同時(shí)整合了Takara Bio Group專(zhuān)利性的文庫構建技術(shù)(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823)及雙端特殊index(UDI),簡(jiǎn)化了測序文庫流程。PicoPLEX技術(shù)使用準線(xiàn)性擴增方法,可以對單細胞或微量DNA樣本進(jìn)行高再現性的非整倍體異倍性和CNV分析。在建庫階段可以在單管中進(jìn)行(包括DNA片段化、末端修復、接頭添加、PCR擴增和index添加流程),約2個(gè)小時(shí)即可完成,無(wú)需純化或樣品轉移步驟,可以盡可能的減少樣品損耗!
測序后,可以使用我們專(zhuān)門(mén)的Embgenix Analysis Software (RUO) 對非侵入性樣品進(jìn)行數據分析。這個(gè)軟件的算法是基于內部配置的參考基因組,采用bin counts計算CCNs(calculated copy numbers)來(lái)確定最終的CNV準確度。該軟件允許用戶(hù)自主選擇自動(dòng)或手動(dòng)設置來(lái)分析是整個(gè)染色體、還是節段非整倍體,或者是嵌合體,而且生成的數據可以在圖表中可視化展示。另外,數據分析結果支持下載為PDF報告,也可以根據每個(gè)實(shí)驗室需求進(jìn)行定制。
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■ 實(shí)驗流程概要:
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