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友名生物

U-Me

含UMI的單細胞RNA-Seq分析試劑盒

2022-12-02文章來(lái)源:takarabiomed
省流:上新品,有促銷(xiāo),含UMI的單細胞RNA-Seq分析試劑盒!
 
前言
什么是單細胞轉錄組測序?
單細胞轉錄組測序,簡(jiǎn)單來(lái)講,就是在單個(gè)細胞水平上,對轉錄組等遺傳信息進(jìn)行高通量測序分析的一項技術(shù)。與常規高通量測序相比,能夠在更精細的單個(gè)細胞水平上獲得遺產(chǎn)信息,從而揭示每個(gè)細胞的基因表達狀態(tài)。
 
單細胞mRNA-seq的挑戰是什么?
研究罕見(jiàn)或珍貴的樣本,比如神經(jīng)元細胞、干細胞、CTC等,需要非常高的靈敏度和再現性,因為單個(gè)細胞中RNA的含量十分有限(根據單個(gè)細胞的大小等情況不同,每個(gè)細胞可能只含有幾十皮克的RNA)。因此,生成沒(méi)有偏倚的mRNA-seq cDNA文庫是很具有挑戰性的一項工作。
創(chuàng )新研究不斷推動(dòng)新技術(shù)的邊界,以獲得引人注目的結果,而這其中仍然需要試劑、技術(shù)的支撐。在單細胞RNA-seq領(lǐng)域,Takara Bio提供的SMART技術(shù),可以幫助研究人員進(jìn)一步突破RNA-seq靈敏度上限,提供高質(zhì)量的單細胞轉錄組分析結果。本次升級的產(chǎn)品SMART-Seq mRNA LP (with UMIs),是整合UMI的單細胞/微量樣本的mRNA全長(cháng)分析建庫試劑盒。
 
產(chǎn)品亮點(diǎn)
· “高端”的技術(shù)萬(wàn)里挑一
基于Takara Bio的核心SMART技術(shù)(Switching Mechanism at 5' End of RNA Template)優(yōu)化改良,提供全長(cháng)轉錄本信息,可以高靈敏度在單細胞水平上分析差異表達、融合基因、可變剪接等。
 
· 加持的“標簽”鼎力相助
通過(guò)逆轉錄步驟添加分子標簽(UMIs),可以靈敏地識別PCR重復片段,并校正PCR擴增錯誤,從而獲得更高準確性的基因或轉錄本檢測數。
 
· 連貫的文庫構建流程
同時(shí)整合了Takara Bio專(zhuān)利性 的文庫構建技術(shù)(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, 和11,072,823),利用特別的莖環(huán)形接頭構建高品質(zhì)Illumina文庫!另外,搭配使用Unique Dual Index Kits(單獨銷(xiāo)售),可以提供完整的從樣品到cDNA合成到文庫構建的實(shí)驗體驗。同時(shí)搭配特別開(kāi)發(fā)的Cogent NGS生物信息學(xué)分析軟件,能直接對下機數據進(jìn)行分析!
 
性能展示
· 再現性測試數據
以10 pg K562 RNA以及3種不同起始量 (100 pg, 1 ng和10 ng)的 UHR RNA樣本起始,使用SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)構建測序文庫,均做3個(gè)重復。然后進(jìn)行測序,并使用CogentAP進(jìn)行分析。結果顯示,重復之間相關(guān)性系數非常高。即使起始量為10 pg時(shí),也具有非常高的重現性!
 
· 靈敏度測試數據
對36例核酸含量較低的PBMC樣本,使用SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)制備文庫,并進(jìn)行測序分析。結果顯示,通過(guò)基因表達譜分析確認了70%的PBMC是T細胞,這符合來(lái)自正常健康供體的PBMC預期比例。此外,還鑒定確認一個(gè)B細胞、一個(gè)NK細胞,一個(gè)單核細胞和兩個(gè)樹(shù)突狀細胞,另有6個(gè)細胞無(wú)法明確類(lèi)型。由此也說(shuō)明SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)在單細胞水平的RNA-Seq分析上具有高靈敏度。
 
· 添加UMI校正偏差
分別對10 pg RNA和單個(gè)細胞獲得的RNA樣本,摻入ERCC control RNA后進(jìn)行文庫制備,然后進(jìn)行測序分析。結果顯示,添加UMI后,決定系數R2值明顯提高,表明添加UMI降低PCR duplication,獲得更準確的RNA counts。
 
· 兼容自動(dòng)化平臺
SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)兼容多種自動(dòng)化液體工作站進(jìn)行微縮化建庫。比如使用SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)在Mantis Liquid Handler (Formulatrix)上將反應體系體積微縮至1/2(HV),1/4(QV)以及在mosquito HV liquid handler (SPT Labs)上將反應體系體積微縮至1/8,均能獲得與使用原反應體系高度一致的結果。保證性能的同時(shí),降低了成本和操作時(shí)間!
 
PS:另外還有兩款新品,也值得關(guān)注哦!
· SMART-Seq® mRNA LP少量細胞/微量樣本的mRNA-Seq文庫構建試劑盒。它使用oligo(dT)引物起始,優(yōu)化用于從10 pg-100 ng的高品質(zhì)total RNA(RIN≥8)或1-1000個(gè)完整細胞起始,生成高質(zhì)量的測序文庫。
· SMART-Seq® mRNA 少量細胞/微量樣本的cDNA合成試劑盒。它可以用于Ultra low RNA(10 pg-100 ng)或少量細胞(1-1000個(gè)完整細胞)cDNA合成的試劑盒,提供全長(cháng)轉錄本的信息。
 
產(chǎn)品名稱(chēng) cDNA合成 文庫制備 包含分子標簽
SMART-Seq mRNA LP(with UMIs)
SMART-Seq mRNA LP ×
SMART-Seq mRNA × ×
 
新品嘗鮮活動(dòng)
看完心動(dòng)的您,剛好可以參加一下新品首發(fā)直降福利哦!
· 活動(dòng)時(shí)間:2022年11月29日-2022年12月23日
· 活動(dòng)品目及價(jià)格:
Code No. 產(chǎn)品名稱(chēng) 包裝量 目錄價(jià)格 優(yōu)惠價(jià)格
634762 SMART-Seq mRNA LP(with UMIs) 24 Rxns ¥19,350 ¥16,448
634765 SMART-Seq mRNA LP(with UMIs) 96 Rxns ¥65,793 ¥55,924
634768 SMART-Seq mRNA LP 24 Rxns ¥17,917 ¥15,229
634769 SMART-Seq mRNA LP 96 Rxns ¥60,919 ¥51,781
634772 SMART-Seq mRNA 24 Rxns ¥15,184 ¥12,906
634773 SMART-Seq mRNA 96 Rxns ¥51,626 ¥43,882
634756 Unique Dual Index Kit (1–24) 24 Rxns ¥2,632 ¥2,237
634752 Unique Dual Index Kit (1–96) 96 Rxns ¥7,087 ¥6,024
 
注:活動(dòng)期間,每位客戶(hù)僅限一次訂單有效。