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WGA/ThruPLEX DNA-seq如何助力健康三孩

2021-08-02文章來(lái)源:takarabiomed
三孩政策下,看輔助生殖技術(shù)如何實(shí)現“好孕自然來(lái)”?

想必前段時(shí)間,大家都被這條消息刷屏:
5月31日,中共中央政治局會(huì )議審議《關(guān)于優(yōu)化生育政策促進(jìn)人口長(cháng)期均衡發(fā)展的決定》,提出進(jìn)一步優(yōu)化生育政策,實(shí)施一對夫妻可以生育三個(gè)子女政策及配套支持措施。

 
優(yōu)生優(yōu)育的有效手段之一---輔助生殖技術(shù)
 
根據第七次全國人口普查數據顯示,我國目前呈現出生育率下降、老齡化水平升高的人口結構特點(diǎn)。實(shí)施三孩生育政策,有利于改善人口年齡結構,降低老齡化峰值水平,促進(jìn)人口長(cháng)期均衡發(fā)展。
三孩政策的落地,離不開(kāi)政策及配套支持措施的實(shí)施。除了托幼、教育等的配套支持,醫療的支持也十分重要?!叭ⅰ睍r(shí)代的到來(lái),也意味著(zhù)高齡孕婦的數量將隨之增加,再加上客觀(guān)存在的婚育年齡推遲的情形,都可能使得出生缺陷率和不孕不育的風(fēng)險率增加,而輔助生殖技術(shù)的出現正好可以解決這些難題,幫助提升生育質(zhì)量和生育率。
 
什么是輔助生殖?
輔助生殖技術(shù)(包括人類(lèi)輔助生殖技術(shù)和人類(lèi)精子庫)是指運用醫學(xué)技術(shù)和方法對配子、合子、胚胎進(jìn)行人工操作,以達到受孕目的的技術(shù),分為人工授精技術(shù)、體外受精-胚胎移植技術(shù)及相關(guān)衍生技術(shù)【1】。
其中體外受精-胚胎移植技術(shù)及其各種衍生技術(shù)(In vitro fertilization, IVF)近些年來(lái)備受關(guān)注。簡(jiǎn)單的說(shuō),就是大家耳熟能詳的試管嬰兒技術(shù)。
 
“試管嬰兒”的前世今生?
1978年世界上首例試管嬰兒誕生,從此開(kāi)創(chuàng )了生殖醫學(xué)領(lǐng)域的新紀元。
試管嬰兒是指從女性體內取出卵子,在器皿內培養后,加入經(jīng)技術(shù)處理的精子,待卵子受精后,繼續培養,到形成早早期胚胎時(shí),再轉移到子宮內著(zhù)床,發(fā)育成胎兒直至分娩的技術(shù)【1】。
 
試管嬰兒技術(shù)的分類(lèi)
 
技術(shù) 原理
第一代試管嬰兒
體外受精-胚胎移植(IVF-ET)
指將精子和卵子置于體外,利用各種技術(shù)使卵子受精,經(jīng)過(guò)培養發(fā)育成胚胎后轉移到子宮內著(zhù)床,發(fā)育成胎兒直至分娩的技術(shù)
第二代試管嬰兒
卵胞漿內單精子注射-胚胎移植(ICSI-ET)
指將精子通過(guò)顯微注射的方法注入卵細胞內,其他過(guò)程同IVF-ET
第三代試管嬰兒
植入前胚胎遺傳學(xué)診斷技術(shù)(PGT)
指胚胎植入前,取胚胎的遺傳物質(zhì)進(jìn)行分析,篩選健康胚胎進(jìn)行移植
 
第三代試管嬰兒的分類(lèi)
 
新名稱(chēng) 舊名稱(chēng)
PGT-A
Preimplantation Genetic Testing for Aneuploidies
植入前胚胎染色體非整倍體檢測
PGS
Preimplantation Genetic Screening
植入前胚胎遺傳學(xué)篩查
PGT-M
Preimplantation Genetic Testing for Monogenic
植入前胚胎單基因病檢測
PGD
Preimplantation Genetic Diagnosis
植入前胚胎遺傳學(xué)診斷
PGT-SR
Preimplantation Genetic Testing for Chromosomal Structural Rearrangements
植入前胚胎染色體結構異常檢測
 
為什么選擇PGT-A?
雖然試管嬰兒技術(shù)給不孕不育的夫婦帶來(lái)了希望,但胚胎染色體數目異常在常規體外受精中較常發(fā)生,且高齡女性胚胎染色體異常的發(fā)生率更高。
PGT-A技術(shù),對植入前的胚胎細胞進(jìn)行染色體非整倍體以及染色體拷貝數變異檢測,選擇染色體數目正常的胚胎,可有效提高體外受精的成功率,有助于輔助生殖技術(shù)的推廣應用。
 
PGT-A的研究方法
前幾年主要通過(guò)熒光原位雜交(FISH)技術(shù)、比較基因組雜交芯片(aCGH)技術(shù)進(jìn)行PGT-A分析。隨著(zhù)二代測序(NGS)的快速發(fā)展,人們將目光轉向NGS方法,以期進(jìn)行更正確的評估。
 
PGT-A研究的難點(diǎn)之一是選擇合適的單細胞全基因組擴增技術(shù)
基于NGS技術(shù)進(jìn)行PGT-A研究時(shí),由于每個(gè)胚胎細胞中的DNA非常少(皮克級),遠沒(méi)有達到測序所需的樣品量,因此需要先對單細胞內的DNA進(jìn)行全基因組擴增(whole genome amplification, WGA),而這一過(guò)程必須盡可能避免樣本的損失和污染,并盡可能保證擴增的覆蓋度、均一性等,這都是極其困難的,所以選對單細胞全基因組擴增技術(shù)很重要!
 
Takara致力于通過(guò)卓越的技術(shù)為科學(xué)研究提供支持,傾力推出的PicoPLEX技術(shù),目前廣泛用于PGT-A研究。接下來(lái)讓我們一起來(lái)看一下
 
PicoPLEX技術(shù)是如何正確而高效的進(jìn)行PGT-A研究
 
· 操作簡(jiǎn)便,避免珍貴樣品的損失
整個(gè)實(shí)驗過(guò)程是 “飛一般的感覺(jué)”(見(jiàn)下圖),就三小時(shí),就三步(細胞裂解→預擴增→低背景的PCR擴增),便可獲得微克級的DNA產(chǎn)物。過(guò)程中不需要轉管和純化,減少過(guò)多實(shí)驗操作可能帶來(lái)的樣本損失!
 
· 炫酷的“準線(xiàn)性預擴增+發(fā)夾結構”加持,保證擴增的均一性
在經(jīng)過(guò)細胞裂解后,以DNA作為模板使用準線(xiàn)性擴增方法進(jìn)行預擴增,并在每個(gè)循環(huán)最后形成一個(gè)不能被進(jìn)一步擴增的發(fā)夾結構,這樣做的好處是有效避免PCR過(guò)程中可能引入的擴增錯誤無(wú)限放大,避免序列偏向性。
 
· 可用于高品質(zhì)的染色體變異(CNV)分析
利用單卵裂球活體組織檢查樣品進(jìn)行PicoPLEX WGA Kit擴増標記后,與24 sure array雜交,結果清晰地顯示了CNV(上圖)。2011年ESHRE(歐洲人類(lèi)生殖與胚胎學(xué)會(huì ))的臨床實(shí)驗證明了采用PicoPLEX 技術(shù)進(jìn)行人類(lèi)染色體核型分析的準確性。
 
· 實(shí)例大公開(kāi):進(jìn)行PGT研究時(shí),PicoPLEX性能出色
來(lái)自西班牙Sistemas Genómicos Ltd.的Vendrell【2】的團隊,開(kāi)發(fā)了一種高度可靠的檢測單個(gè)卵裂球和5-10滋養外胚層細胞樣品的染色體異倍性的實(shí)驗方法。其中使用PicoPLEX試劑盒擴增獲得gDNA產(chǎn)物用于后續NGS分析。實(shí)驗表明,未擴增的對照DNA樣品和來(lái)自單個(gè)卵裂球的WGA產(chǎn)物在測序數據上基本沒(méi)有差異,且可以正確地檢測染色體異倍性。
表明使用PicoPLEX技術(shù)具有高再現性,適用于PGT-A分析。
 
PGT-A 的NGS解決方案
 
 
產(chǎn)品名稱(chēng) Code No 包裝量 產(chǎn)品類(lèi)型
PicoPLEX WGA Kit R30050 50 Rxns 單細胞全基因組擴增試劑盒
R300644 500 Rxns
ThruPLEX DNA-Seq HV R400741 24 Rxns DNA建庫試劑盒
R400740 96 Rxns
ThruPLEX DNA-Seq HV PLUS Kit R400782 24 Rxns 含酶切片段化模塊的DNA建庫試劑盒
R400783 96 Rxns
 
參考信息及文獻來(lái)源
1. 中華人民共和國國家衛生健康委員會(huì )官網(wǎng)
2. Vendrell, X. et al. New protocol based on massive parallel sequencing for aneuploidy screening of preimplantation human embryos. Syst. Biol. Reprod. Med. 63, 162–178 (2017).