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均一化的酵母雙雜交cDNA文庫——Normalized Mate & Plate | |||||||||||||||||||||||
■ 制品說(shuō)明 | |||||||||||||||||||||||
Normalized Mate and Plate Libraries是高度復雜的cDNA文庫,文庫克隆到GAL4 AD載體上并轉化到酵母菌株Y187中。因為文庫擴增和酵母轉化操作已經(jīng)完成,所以使用這些文庫進(jìn)行雙雜交篩選更加省時(shí)省力。均一化處理降低了文庫中高豐度的轉錄本,低豐度及稀少的cDNA得以富集,這樣的文庫更加具有基因代表性,也使篩選操作更加簡(jiǎn)單,并大大降低了在篩選文庫時(shí)獲得假陽(yáng)性的可能性。 · 操作僅需三步: 1. 用Matchmaker Gold Yeast Two-Hybrid System構建表達目的蛋白質(zhì)的酵母菌株。 2. 將bait菌株與1 ml均一化文庫混合過(guò)夜培養。 3. 鋪板于篩選培養基上。 · 什么是均一化文庫? 均一化處理降低了cDNA文庫中高豐度轉錄本所占的比例,這意味著(zhù)許多管家基因的拷貝數顯著(zhù)降低,所以篩選的克隆數更少,并且可以確保篩選到包含中等豐富和低等豐度轉錄本的克隆。簡(jiǎn)而言之,您可以花費較少的精力篩選到更多的獨立克隆,并有更大的機會(huì )檢測到重要的互作。 · 如何制備均一化文庫? 首先用SMART技術(shù)擴增獲得cDNA,之后用雙鏈特異性核酸酶(DSN)進(jìn)行均一化處理(1,2)。簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),cDNA經(jīng)變性及退火后,用特異切割雙鏈DNA的酶快速酶切,因為cDNAs豐度越高退火越快,越有可能被酶降解。最后,用Northern blot方法分析cDNA均一化效率,將均一化的cDNA文庫克隆到prey載體pGADT7-RecAB上。 · 通用型文庫提供通用型基因覆蓋范圍 人和小鼠通用型文庫提供了廣泛且完善的表達基因覆蓋范圍。這些均一化通用型文庫來(lái)自于不同的齊全組織,這些特異挑選的組織能夠代表廣闊范圍內表達的基因(2)。結合“全面的”基因代表性及低拷貝cDNAs的富集度,Mate & Plate Universal (Normalized) Libraries為鑒定新的真實(shí)的互作提供了更大的可能。 · 為什么使用均一化通用型文庫? 事實(shí)上,許多有意義的互作發(fā)生在位置適宜但表達較弱的蛋白質(zhì)之間,這類(lèi)互作用傳統的單一組織文庫不容易檢測到。通用型且均一化的文庫為這個(gè)問(wèn)題提供了有效的解決方法,因為這些文庫代表了平衡的轉錄本,能夠更大范圍的覆蓋表達的基因。因此,篩選不再局限于僅能鑒定出單一組織中高水平表達的蛋白質(zhì)之間的互作。 |
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■ 制品特點(diǎn) | |||||||||||||||||||||||
1. 為蛋白質(zhì)互作中的文庫篩選提供簡(jiǎn)便方法。 2. 篩選更少的克隆,檢測更多的互作。 3. 通用型文庫——更高的基因代表性。 4. 篩選不再大海撈針。 |
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■ 制品用途 | |||||||||||||||||||||||
1. 酵母雙雜交文庫篩選。 | |||||||||||||||||||||||
■ 文獻 | |||||||||||||||||||||||
1. Zhulidov, P. A. et al. (2004) Nucleic Acids Res. 32(3):e37. 2. Shagin, D. A. et al. (2002) Genome Res. 12(12):1953-1942. |
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http://www.clontech.com/CN/Products/Protein_Interactions_and_Profiling/Yeast_Two-Hybrid/Libraries/Mate_and_Plate_Normalized?sitex=10022:22372:US |